0
O vírus da peste suína africana (PSA) está atualmente a causar uma pandemia global altamente letal em suínos domésticos e javalis. Atualmente, estão disponíveis comercialmente no Vietname vacinas recombinantes vivas atenuadas baseadas numa estirpe do genótipo II do vírus. Com 25 genótipos do vírus da PSA descritos na literatura, é importante compreender a base molecular e a utilidade da genotipagem do vírus da PSA, bem como a verdadeira importância dos genótipos na epidemiologia, transmissão, evolução, controlo e prevenção do vírus da PSA. Historicamente, a genotipagem do vírus da PSA era utilizada para a monitorização epidemiológica da doença e baseava-se na análise de pequenos fragmentos que representavam menos de 1% do genoma do vírus.
Métodos: O método predominante para a determinação do genótipo do vírus da PSA baseia-se na sequenciação de um fragmento do gene que codifica a proteína estrutural p72.A genotipagem tem sido efectuada utilizando árvores filogenéticas automatizadas ou comparando a sequência-alvo com o gene p72 genotipado mais estreitamente relacionado. Para avaliar a sua adequação à genotipagem por p72, todos os dados genómicos disponíveis para o vírus da PSA foram reanalisados neste estudo.
Resultados: Concluiu-se que a maioria dos genótipos baseados no gene p72, quando inicialmente criados, não foram identificados segundo quaisquer critérios metodológicos específicos nem corretamente comparados com os genótipos existentes do vírus da PSA.
Conclusão: Com base na análise das sequências da proteína p72, propõe-se que os actuais vinte e cinco genótipos, criados exclusivamente a partir da sequência p72, sejam reduzidos a apenas seis genótipos. Para ajudar a diferenciar entre o novo e o antigo sistema de classificação de genótipos, propõe-se a utilização de algarismos árabes (1, 2, 8, 9, 15 e 23) em vez dos algarismos romanos anteriormente utilizados. Além disso, discute-se a utilidade da genotipagem de isolados de vírus da PSA com base apenas na sequência do gene p72.
Spinard E, Dinhobl M, Tesler N, Birtley H, Signore AV, Ambagala A, Masembe C, Borca MV, Gladue DP. A Re-Evaluation of African Swine Fever Genotypes Based on p72 Sequences Reveals the Existence of Only Six Distinct p72 Groups. Viruses. 2023; 15(11):2246. https://doi.org/10.3390/v15112246
