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Diagnóstico laboratorial: E. coli (diarreia)

Que métodos de diagnóstico laboratorial posso usar para diagnosticar E. coli? Qual devo escolher de acordo com a situação? Como posso interpretar os resultados?

E. coli no hemolítica (izquierda) y E. coli hemolítica (derecha)
E. coli no hemolítica (izquierda) y E. coli hemolítica (derecha)

Testes disponíveis

Cultivo bacteriano

  • Isolamento de organismos vivos
  • Tipo de amostra: fezes, conteúdo intestinal.
  • Prós:
    • As bactérias são fáceis de cultivar num 1 dia
    • Fácil de fazer em qualquer laboratório (inclusive interno)
    • Custo relativamente baixo
  • Contras:
    • Algumas E. coli fazem parte da flora intestinal normal
    • Os porcos têm múltiplas E. coli ao mesmo tempo
    • Se os porcos foram tratados antes com antibióticos, isto pode impedir o crescimento bacteriano

Susceptibilidade antimicrobiana (antibiograma)

  • Teste in vitro: capacidade de um organismo vivo para crescer sob concentrações específicas de diferentes antimicrobianos
  • Tipo de amostras: fezes, conteúdo intestinal
  • Prós:
    • Identificação de susceptibilidade ou resistência de estirpes específicas a antimicrobianos comuns
    • Identificação de tendências de resistência aos antimicrobianos
  • Contras:
    • Requer um isolado bacteriano
    • Os testes in vitro podem diferir ligeiramente dos resultados in vivo
    • É possível que alguns antimicrobianos específicos não sejam incluídos ou requeiram testes especiais separados
    • Custo moderado

Histopatologia

  • Avalia a presença de lesões de tecido (dano) que podem confirmar a presença de doença. Às vezes, a presença de organismos também pode ser detectada directamente (bactérias e parasitas) ou indirectamente (vírus) usando colorações especiais adicionais.
  • Tipo de amostra: tecidos.
  • Prós:
    • Associa adesão bacteriana com dano intestinal
    • Nenhuma coloração especial é necessária
  • Contras:
    • Os tecidos intestinais precisam de fixação com formalina dentro de 15 minutos após a morte do animal. O tecido intestinal decompõe-se rapidamente.
    • A doença pode ser segmentar, portanto devem ser enviadas várias amostras intestinais.

Genotipado

  • Técnica de PCR (reacção em cadeia da polimerase), que detecta a presença de uma sequência específica de ácidos nucléicos (DNA) associada a genes de virulência conhecidos.
  • Prós:
    • PCR fácil de fazer.
    • Ajuda a identificar a patogenicidade detectando a presença de genes (não necessariamente expressão génica) associados a factores de virulência.
      • Genes de toxina: EAST1, LT, STa, STb, Stx1, Stx2, Stx2e.
      • Genes Pilus: F18, F41, K88 (F4), K99 (F5), 987P (F6).
      • Genes de adesão: AIDA, EAEA, PAA.
    • Facilita a seleção adequada da vacina (baseada em pili).

Genes de E. coli detectados por genotipificação por PCR e pela sua função

Gene Tipo Descrição
EAST1 Toxina A toxina intestinal liga-se ao mesmo receptor e estimula a mesma via secretora que a Sta (a causa da diarreia não está bem estabelecida)
LT Toxina Toxina intestinal que estimula a secreção intestinal
STa Toxina Toxina intestinal que estimula a secreção intestinal principalmente em porcos jovens (diminui a absorção de água e electrólitos)
STb Toxina Toxina intestinal que estimula uma diarreia secretora principalmente em porcos de mais idade (aumenta a secreção dos enterócitos)
Stx1 Toxina O tóxico intestinal pode encontrar-se em estirpes patogénicas e não patogénicas
Stx2 Toxina O tóxico intestinal pode encontrar-se em estirpes patogénicas e não patogénicas.
Stx2e Toxina Toxina sistémica que induz dano vascular e doença dos edemas.
F18 (F107) Adhesina Pili (fimbria) utilizado para adesão que está presente depois dos 20 dias de idade e frequentemente associado com diarreia pós-desmame e doenças dos edemas
F41 Adhesina Pili (fimbria) usada para a adesão principalmente em recém-nascidos.
K88 (F4) Adhesina Pili (fimbria) usada para permitir adesão desde o nascimento a todas as idades.
K99 (F5) Adhesina Pili (fimbria) usada para a adesão principalmente em recém-nascidos.
987P (F6) Adhesina Pili (fimbria) usada para a adesão principalmente em recém-nascidos.
AIDA Adhesina

"Adesina envolvida na aderência difusa" não fimbrial, mais frequentemente encontrada junto com F18.

EAE Adhesina Adesina não-fimbrial que contribui para as lesões de adesão "attaching-and-effacing"
PAA Adhesina Adesina não-fimbrial essencial para que se produzam as lesões de adesão "attaching-and-effacing" .
  • Contras:
    • Requer um isolamento bacteriano.
    • Os porcos podem ter mais de uma estirpe ao mesmo tempo pelo que devemos esperar que tenhamos isolado a estirpe correcta.
    • Preço moderado, mas normalmente apenas é analisada uma estirpe isolada

Interpretação de resultados

Cultivo bacteriano

  • A interpretação da hemólise depende da idade dos animais:
    • Pré-desmame: E. coli. não hemolítico
    • Pós-desmame: E. coli hemolítica.
  • Pureza:
    • Crescimento puro: altamente sugestivo de que está a contribuir para a doença.
    • Crescimento misto: valor questionável.
  • Quantidade:
    • Alto: altamente sugestivo de que está contribuindo para a doença.
    • Moderado: interpretação variável.
    • Baixo: valor questionável (pode ser um contaminante).
    • Sem crescimento: Animal possivelmente previamente tratado com antibióticos ou agente sem contribuição significativa.

Susceptibilidade antimicrobiana (antibiograma):

  • Susceptível: Possível boa escolha para o tratamento se o antimicrobiano puder atingir o tecido-alvo.
  • Resistente: um antimicrobiano diferente deve ser selecionado.
  • MIC: se for realizada a MIC (concentração inibitória mínima), certifique-se de que o antimicrobiano seleccionado atinge o valor de MIC indicado no órgão alvo.

Histopatologia

  • Positivo: Forte associação como causador se for capaz de demonstrar lesões intestinais com E. coli aderida a células epiteliais.
  • Negativo: Sem lesões intestinais.

Genotipado

  • O genotipado é muito valioso para identificar se a E. coli isolada contém algum dos factores de virulência que apoiariam o isolado como agente patogénico.

Cenário

Porcos com diarreia (qualquer idade) :

  • Recolha de zaragatoas rectais de 2 ou mais porcos com diarreia não tratados com antibióticos e envie-os para cultura bacteriana, antibiograma e genotipagem.
  • Eutanásia 1-3 leitões com diarreia que não receberam tratamento. Recolha imediatamente 3 amostras de intestino de cada leitão e colocá-las em solução de formaldeído. Recolha amostras frescas de intestino para enviá-las refrigeradas para cultura bacteriológica, antibiograma e genotipagem.

Consulta o "guía de doenças" para mais informação

Diarreia por E. coliA diarreia por E. coli afecta, principalmente, os leitões lactantes provocando grande mortalidade tornando-a uma das diarreias mais frequentes e a mais importante.

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